Postdoktor i molekylär tumörbiologi - Befattningen är under tillsättning eller redan tillsatt, och det är inte längre möjligt att lämna in en ansökan

Institutionen för molekylärbiologi söker en postdoktor för en tidsbegränsad anställning på två år motsvarande heltid med start snarast möjligt eller enligt överenskommelse.

Projektbeskrivning

Projektet fokuserar på betydelsen av RNA-splitsning för neuroblastom. Framför allt inriktar sig projektet på analys av sekvensdata i tumörer behandlade med inhibitorer som blockerar RNA-splitsning.

Arbetsuppgifter

• Designa och utveckla bioinformatiska flöden via ”Netflow” för heltäckande genomisk och transkriptionell analys.
• Genomföra avancerad analys av ”long-read”-sekvensdata, med ett särskilt fokus på transkriptomanalys via plattformar som PacBio och Oxford Nanopore.
• Genomföra differentiell splitsningsanalys av ”long read” data för att identifiera och karakterisera alternativa transkript.
• Delta i encells-sekvensanalys och bidra med insikter i vår pågående forskning rörande cellulär heterogenitet.
• Samarbeta med ett multidisciplinärt team för att tolka data och bidraga med att föra forskningen framåt.

Behörighet 

Behörig att anställas som postdoktor är den som avlagt doktorsexamen, eller utländsk examen som bedöms motsvara doktorsexamen, inom Bioinformatik, Beräkningsbiologi, Genetik eller närliggande område. Detta behörighetskrav ska vara uppfyllt senast vid tidpunkten då anställningsbeslutet fattas. 

Den sökande skall ha följande kvalifikationer:

• Påvisad skicklighet i Python för bioinformatikapplikationer.
• Erfarenhet av pipelineutveckling för genomanalys, helst med Nextflow.
• Djupgående kunskap inom long-read sekvenseringstekniker och deras tillämpning inom transkriptomforskning.
• Erfarenhet av arbete inom miljöer för högpresterande databehandling (HPC) och lokala datamiljöer.

Meriterande 

Eftersom anställning som postdoktor utgör en meriteringsanställning för juniora forskare, riktar vi oss främst till den som har en doktorsexamen som inte är äldre än tre år räknat från sista ansökningsdag. Om det finns särskilda skäl kan den komma i fråga som avlagt doktorsexamen tidigare. Med särskilda skäl avses ledighet på grund av sjukdom, föräldraledighet, klinisk tjänstgöring, förtroendeuppdrag inom fackliga organisationer eller andra liknande omständigheter, samt för ämnesområdet relevant tjänstgöring/uppdrag. 

Meriterande färdigheter:

• Grundläggande kunskap om tekniker och dataanalys för single-cell sekvensering.
• Erfarenhet av differentiell splitsningsanalys på transkript-, exon- och eventnivå.
• Erfarenhet av ytterligare programmeringsspråk såsom R eller Perl.
• Erfarenhet av maskininlärningsmetoder inom kontexten för genom och transkriptomanalys.

Ansökan

Ansökan ska innehålla:

• En kort beskrivning av forskningsintressen och motivering till varför du är intresserad av anställningen.
• CV
• Publikationslista
• Examensbevis från forskarutbildning samt andra relevanta examina
• Kontaktinformation till två referenspersoner

Ansökan ska vara skriven på svenska eller engelska. Ansökan ska göras via vårt e-rekryteringssystem Varbi och vara inkommen senast den xx december 2023.

Välkommen med din ansökan!

Mer om anställningen

Anställningen är en tidsbegränsad anställning på heltid i två enligt villkor i avtal om tidsbegränsad anställning som postdoktor. Mer information om gruppens forskning finns att läsa på vår websida https://www.umu.se/en/research/groups/johan-holmberg/. För mer information om Institutionen för molekylärbiologi vänligen besök vår hemsida www.umu.se/molbiol.