Första forskningsingenjör inom bioinformatik /webbutveckling 

Umeå Plant Science Center (UPSC) är en av Europas starkaste forskningsmiljöer för växtgrundforskning(www.upsc.se). Vårt gemensamma mål är att förstå växternas anpassningsförmåga och acklimatisering till en föränderlig omvärld.

Institutionen för fysiologisk botanik (www.umu.se/institutionen-for-fysiologisk-botanik), som utgör en av parterna i UPSC, söker en första forskningsingenjör som kommer att arbeta med bioinformatisk webbutveckling. Anställningen är tillsvidare med tillträde omgående eller enligt överenskommelse.

Projektbeskrivning och arbetsuppgifter

Du kommer att arbeta i en gemensam forskningsmiljö vid institutionen för fysiologisk botanik i samarbete med team på UPSC bioinformatikanläggning, National Bioinformatics Infrastructure Sweden (NBIS), programmet Data Driven Life Science (DDLS) och Vlaams Instituut voor Biotechnologie (VIB) , Gent, Belgien. Ett aktuellt fokus för positionen kommer att ligga på genomprojektet av gran och tall och att stödja behoven av webbresursinfrastruktur hos forskargrupper vid UPSC. I arbetet ingår utveckling av webbresursen PlantGenIE.org. Det kommer att finnas ett antal milstolpar i utvecklingen, inklusive integrationen av DNA-sekvenseringsdata från hela populationer, data från genomomfattande associationsstudier (GWAS), genuttrycksdata och genuttrycksnätverk, inklusive nya analys- och visualiseringsverktyg. Arbetet kommer att fokusera på att tillämpa principer från människa-datorinteraktion och designfilosofi för att förbättra användbarheten (UX) och användargränssnittet (UI) för PlantGenIE och på utveckling av API:er för att öka FAIR-efterlevnaden. I denna del av arbetet kommer du att använda dig av webbanalys och användarundersökningar för att kunna fatta välgrundade designbeslut.

Kvalifikationer

Doktorsexamen i bioinformatik, datavetenskap, människa-datorinteraktion eller motsvarande krävs. Den sökande ska ha arbetslivserfarenhet inom bioinformatik, webbdesign och interaktion mellan människa och dator. Erfarenhet av mjukvaruutveckling och/eller avancerad programmering i skriptspråk (som Python) samt lång och dokumenterad erfarenhet av webbutveckling, inklusive användardriven gränssnittsdesign och tillämpning av webbanalysverktyg krävs också. Goda kunskaper i engelska i tal och skrift är ett krav, samt god samarbetsförmåga och förmåga att tänka kreativt, samarbeta i grupp och ta egna initiativ.

Dokumenterad erfarenhet av webbgränssnittsutveckling, databasdesign, arbete i UNIX-miljö och med datorkluster är meriterande. Bekantskap med någon av ReactJS, gosling.js, Neo4j, php och liknande webbteknologier är mycket fördelaktigt. Erfarenhet av analys och visualisering av nästa generations sekvenseringsdata (t.ex. RNA-sekvenseringsdata och gennätverk) är också meriterande liksom förståelse för grundläggande molekylärbiologi. Vi använder Git flitigt så förtrogenhet med koddelningssystem är önskvärt och kommer att vara en nödvändig arbetsrutin.

Ansökan

Ansökan ska innehålla:

• Ett personligt brev där du beskriver dig själv, och dina tidigare relevanta forskningserfarenheter. Brevet ska innehålla länkar till dina tidigare arbeten inom webbutveckling, användargränssnitt och webbdesign som kan visa varför du är kvalificerad för anställningen max 2 sidor).
• CV
• Styrkt kopia av doktorsexamensbevis
• En publikationslista inklusive en länk till din doktorsavhandling.
• Styrkta kopior av betyg och examensbevis.
• Övriga handlingar du vill åberopa.

Du ansöker via vårt e-rekryteringssystem. Ansök via knappen längst ner på sidan. Sista ansökningsdag är 2023-09-13. 

För mer information, vänligen kontakta Professor Nathaniel Street, +46-(0)90-786 5473, nathaniel.street@umu.se. 

Välkommen med din ansökan!