Umeå universitet, Teknisk-naturvetenskaplig fakultet

Umeå universitet är ett av Sveriges största lärosäten med över 37 000 studenter och cirka 4 700 anställda. Vid universitetet finns en mångfald av utbildningar av hög kvalitet och världsledande forskning inom flera vetenskapsområden, och här gjordes den banbrytande upptäckten av gensaxen CRISPR-Cas9 som tilldelats Nobelpriset i kemi. Vid Umeå universitet är allt nära. Våra sammanhållna campus gör det lätt att mötas, samarbeta och utbyta kunskap, något som gynnar en dynamisk och öppen kultur.

Den samhällsomvandling och de stora gröna investeringar vi ser i norra Sverige skapar enorma möjligheter och komplexa utmaningar. För Umeå universitet handlar det om att bedriva forskning om – och mitt i – ett samhälle i omvandling. Men också om att leverera utbildningar för regioner som behöver expandera fort och hållbart. Det är helt enkelt här framtiden skapas.

Är du intresserad av att veta mer? Läs mer om Umeå universitet som arbetsplats.

 

Forskningsingenjör till Institutionen för fysiologisk botanik 

Projektets namn:
Bioinformatiker till UPSCs Bioinformatikplattform

Finansiering:
Bioinformatikplattform (100%)

Beskrivning av arbetsuppgifter

Umeå Plant Science Centre (UPSC) är världsledande inom växtfysiologi och skogsgenetik, där forskningen producerar stora mängder data som kräver bioinformatiska resurser och mjukvaror för analys. I din roll på UPSC:s bioinformatikplattform kommer du att ge stöd och service inom bioinformatik till forskargrupper och delta i olika typer av projekt.

Bioinformatikplattformen söker en forskningsingenjör för att slutföra ett befintligt projekt som involverar maskininlärning på NET-Seq-data. Arbetsuppgifterna inkluderar bearbetning av NET-seq-data, det vill säga komplettering och användning av vår pipeline för dataförbearbetning, kvalitetskontroll, resultatgenerering och presentation. Arbetsuppgifterna innebär även analys av resultaten och integration med andra resurser med hjälp av maskininlärningsmetoder.

Kompetenskrav

Mastersexamen inom beräkningsbiologi, bioinformatik eller motsvarande krävs. Du är väl bekant med Unix/Linux och minst ett programmeringsspråk såsom Python, R, C eller C++. Du har erfarenhet av arbete med NET-Seq data och har kunskap inom maskininlärning. God samarbetsförmåga samt mycket goda kunskaper i engelska krävs. Du måste vidare ha mycket god förmåga att självständigt organisera och rapportera arbetet.

Övriga önskvärda kvalifikationer

Erfarenhet av NGS teknik, särskilt RNA-Seq och proteomik, samt kunskap inom datavetenskap och statistik är meriterande.

Villkor

Anställningen avser heltid och är tidsbegränsad till och med 2023-12-22. Tillträde 2023-07-01 eller enligt överenskommelse.

Ansökan

Ansökan skall innehålla (1) ett personligt brev (2) CV med full publikationslista och (3) kopior på relevanta examen. 

Ansökan ska göras via e-rekryteringssystemet Varbi och vara inkommen senast 2023-05-17

För mer information var vänlig kontakta plattformsansvarig Dr. Nicolas Delhomme, nicolas.delhomme@slu.se alternativt Assoc. Prof. Nathaniel Street, nathaniel.street@umu.se   

 

Välkommen med din ansökan!

 

 

Anställningsform Tidsbegränsad anställning
Anställningens omfattning Heltid
Tillträde 2023-07-01 eller enligt överenskommelse
Löneform Månadslön
Antal lediga befattningar 1
Sysselsättningsgrad 100 %
Ort Umeå
Län Västerbottens län
Land Sverige
Referensnummer AN 2.2.1-761-23
Facklig företrädare
  • SACO, 090-7865365
  • SEKO, 090-7865296
  • ST, 090-7865431
Publicerat 2023-04-26
Sista ansökningsdag 2023-05-17

Tillbaka till lediga jobb