Postdoktor (2 år) i datadriven livsvetenskap för anonymisering av data inom precisionsmedicinsk forskning - Befattningen är under tillsättning eller redan tillsatt, och det är inte längre möjligt att lämna in en ansökan

Integrated Science Lab (IceLab) tillsammans med institutionerna för datavetenskap, fysik och radiofyisik, dynamiska och internationellt framgångsrika miljöer vid Umeå universitet, söker en postdoktor, för ett anonymisering av data inom precisionsmedicinsk forskning. Anställningen är en tidsbegränsad anställning på heltid i två år enligt villkor i avtal om tidsbegränsad anställning som postdoktor från 1 februari 2022.

Denna position är en del av ett samarbete mellan de två största forskningsprogrammen i Sverige, Wallenberg AI, Autonomous Systems and Software Program, (WASP) samt SciLifeLabs och Wallenbergs nationella program för datadriven livsvetenskap (Data-Driven Life Science, DDLS). Målet är att lösa banbrytande tvärdisciplinära forskningsfrågor.

Projektbeskrivning
För att främja biobanksanvändning och precisionsmedicinsk forskning har medicinska fakulteten vid Umeå universitet lanserat PREDICT, ett brett övergripande infrastrukturprojekt för att förstå sjukdomsförlopp, identifiera biomarkörer för tidig upptäckt av sjukdom och för att undersöka samsjukligheter. PREDICT är en precisionsmedicinplattform med etiskt godkännande för att hjälpa biobanksgivare med ett förnyat, modernt informerat samtycke för att koppla biobanksdata till journaler. Projektet kommer gynna PREDICTs mål att bidra till förbättrad hälsa i vår befolkning.

Data som genereras från humana biobanksprover och journaler är känsliga personuppgifter. Hanteringen av känsliga personuppgifter regleras av den allmänna dataskyddsförordningen (GDPR), vilket gör det svårt att dela och återvinna biobanksdata. För optimal användning av biobanksdata syftar detta projekt till att utveckla maskininlärningsmetoder för dataanonymisering och utvärdering av anonymiserade biomedicinska data baserat på datakvalitet och risk för återidentifiering, vilket möjliggör datadelning och återvinning utan begränsningar av GDPR.

Kvalifikationer
Vi söker en motiverad och ansvarstagande kandidat som brinner för att utvecklas som en självständig forskare och gruppmedlem, med:

• Bakgrund inom datavetenskap, fysik eller ett relaterat tekniskt område.
• Programmeringskunskaper i minst ett språk som Go, Rust, Python, R eller Matlab.
• Forskning och praktiska erfarenheter inom datavetenskap, maskininlärning eller relevanta discipliner med verktyg som PyTorch eller Tensorflow.
• Erfarenhet av integritetsskydd eller medicinsk dataanalys är meriterande.

Innehavaren av tjänsten kommer att arbeta tillsammans i IceLab med en tvillingpostdok som kommer att arbeta med snabb interaktiv visualisering med låg distorsion av precisionsmedicindata.

Behörighet
Behörig att anställas som postdoktor är den som avlagt doktorsexamen eller utländsk examen inom medicinsk vetenskap som bedöms motsvara doktorsexamen. Detta behörighetskrav ska vara uppfyllt senast vid tidpunkten då anställningsbeslutet fattas.

Personliga egenskaper som samarbets-, kommunikations- och analytiska förmågor är viktiga. Kandidaten ska ha ett starkt intresse för tvärvetenskaplig forskning, vara mycket motiverad och ha förmåga att arbeta självständigt och som en del av forskargruppen. Goda kunskaper i talad och skriven engelska är ett krav.

Meriterade
Eftersom anställning som postdoktor utgör en meriteringsanställning för juniora forskare, riktar vi oss främst till den som har en doktorsexamen som inte är äldre än tre år räknat från sista ansökningsdag. Om det finns särskilda skäl kan den komma i fråga som avlagt doktorsexamen tidigare. Med särskilda skäl avses ledighet på grund av sjukdom, föräldraledighet, klinisk tjänstgöring, förtroendeuppdrag inom fackliga organisationer eller andra liknande omständigheter, samt för ämnesområdet relevant tjänstgöring/uppdrag.

Ansökan
Ansökan ska innehålla:

• Ett följebrev med kort beskrivning av dina kvalifikationer, forskningsintressen och motivering varför du söker (max 2 sidor)
• En meritförteckning (CV)
• En publikationslista
• Styrkta kopior på relevanta examensbevis, eller, om examensbevis inte har utfärdats ännu, intyg om godkänd avhandling, godkända fullständiga doktorandkurser eller datumet för din planerade avhandling
• Kontaktuppgifter till två referenspersoner (namn, organisation, titel, relation till sökanden, e-post, telefonnummer)

Ansökan ska skrivas på svenska eller engelska. Ansökan ska vara ifylld med vårt e-rekryteringssystem Varbi senast den 8 januari 2023.

Övrig information
I IceLab främjar och underlättar vi transdisciplinära samarbeten – med fokus på spetsforskning som integrerar teoretiskt, beräkningsmässigt och empiriskt arbete. Vi kombinerar matematisk och beräkningsmodelleringsexpertis med ett stort intresse för att arbeta med empiriska forskare. Mer information på https://icelab.se

Institutionen för strålningsvetenskaper är en translationell miljö inom diagnostisk radiologi, onkologi, kognitiv neurovetenskap, strålningsfysik och biomedicinsk teknik samt större biobanks- och multiomicsanalyser. Mer information på https://www.umu.se/en/department-of-radiation-sciences

Institutionen för fysik bedriver stark forskning inom områden inklusive icke-linjär fysik, plasmafysik, kondenserade materiens fysik, nanoteknik, biologisk fysik och komplexa nätverk. Läs mer på https://www.umu.se/fysikavdelningen/

Institutionen för datavetenskap bedriver forskning och forskarutbildning inom ett brett spektrum av datavetenskapsområdet, från AI och autonoma system till datasekretess, maskininlärning, robotik, designoptimering och mer. Läs mer på https://www.umu.se/en/department-of-computing-science

För mer information om anställningen, kontakta Beatrice Melin (beatrice.melin@umu.se) eller Martin Rosvall (martin.rosvall@umu.se)

Information om DDLS: SciLifeLabs och Wallenbergs nationella program för datadriven livsvetenskap (Data-Driven Life Science, DDLS) är ett 12-årigt initiativ fokuserat på datadriven forskning inom områden som är nödvändiga för att förbättra människors liv, upptäcka och behandla sjukdomar, skydda biodiversitet och skapa hållbarhet. Programmet kommer att utbilda och stötta nästa generation av forskare inom livsvetenskap och skapa en stark datavetenskaplig bas. Programmet avser stärka nationella samarbeten mellan universitet, koppla samman forskare inom livs- och datavetenskap samt att skapa samarbeten med industri, sjukvården och andra nationella och internationella aktörer.

Information om WASP: Wallenberg AI, Autonomous Systems and Software Program, WASP, är Sveriges största enskilda forskningsprogram i modern tid. Programmet skapar en plattform för akademisk forskning och utbildning i nära samarbete med ledande svensk teknikintensiv industri. Forskningen innefattar artificiell intelligens och autonoma system som verkar i samarbete med människor och som anpassar sig till sin omgivning med hjälp av sensorer, information och kunskap och skapar intelligenta system av system. WASPs vision är excellent forskning och kompetens inom artificiell intelligens, autonoma system och mjukvara till gagn för svensk industri. 

Välkommen med din ansökan!