Forskningsingenjör i molekylär ekosystemekologi - Befattningen är under tillsättning eller redan tillsatt, och det är inte längre möjligt att lämna in en ansökan

Institutionen för ekologi, miljö och geovetenskap (Umeå universitet) erbjuder en anställning som forskningsingenjör inom ekosystemekologi med fokus på bioinformatik. Anställningen är tillsvidare och förväntas starta  3 mars 2022 eller enligt överenskommelse. Sista ansökningsdag är 2022-02-13. Provanställning kan komma att tillämpas.

Projektbeskrivning
Ekosystem är komplexa och dynamiska system som påverkas av interaktioner mellan organismerna så väl som med miljön. Målet med detta projekt är att undersöka hur klimatförändringar och förändringar i markanvändning påverkar ekosystemen då det gäller sammansättning och diversitet. Detta kräver inte bara högupplösta data som täcker en stor del av den totala diversiteten, utan också långa tidsserier med frekvent provtagning.

Vår strategi är att använda ett unikt arkiv av luftfilter som samlats in veckovis på sex olika platser i Sverige sedan 1965. Vi har nu producerat ett stort dataset som beskriver veckovis biodiversitet i Kiruna (i den sub-arktiska regionen av Sverige) mellan åren 1974 och 2008. Genom DNA-sekvensering kan vi identifiera alla typer av organismer (växter, djur, svampar, bakterier och virus) från alla typer av habitat (mark, vatten och luft). Luftfiltren fångar även DNA från vertebrater tillsammans med parasiterna som lever i deras tarmsystem. Utöver dessa data, har vi sammanställt data över markanvändning och förändringar i väder/klimat i regionen över samma tidsperiod. Datat vi har genererat representerar ett av de största och mest heltäckande data över historisk biodiversitet i världen. Vi kan med hjälp av dessa data nu undersöka hur alla typer organismer i norra Sverige påverkas av förändringar i miljön.

Om anställningen
Projektet kommer att involvera analys av storskaliga sekvenseringsdata tillsammans med data över markanvändning och klimatförändringar i syftet att förstå hur olika organismer påverkas av mänsklig påverkan på miljön. Projektet kommer att innebära nära samarbete med ledande experter inom ekologi samt samverkan med svenska myndigheter och intresseorganisationer.

Arbetsuppgifterna kommer huvudsakligen att bestå av dataanalys i samverkan med andra forskare. En del av arbetsuppgiften kommer också att vara kommunikation och koordinering med andra forskargrupper, myndigheter och intresseorganisationer. Anställningen är tillsvidare.  Provanställning kan komma att tillämpas.

Kompetenskrav
Vi söker dig som är intresserad av ekosystemekologi, dataanalys och kommunikation med så väl forskare som med andra typer av intressenter. Du förväntas ha en masterutbildning inom bioteknik eller motsvarande samt flera års erfarenhet av arbete med genomik och storskalig sekvensanalys samt programmeringsvana och arbete i UNIX/Linux på beräkningskluster. Ett krav är också en god förmåga att kommunicera skriftligt och muntligt på både svenska och engelska. Vi söker dig som är kreativ och kan ta initiativ. Vi ser att du kan arbeta självständigt men samtidigt kan samarbeta inom en större forskningsgrupp och är relationsskapande i ditt arbete.

Meriterande erfarenheter inkluderar metagenomik, uppbyggande av referensdatabaser, k-merbaserad sekvensklassificering, ”read-mapping” och Pythonprogrammering. Urvalet kommer att baseras på ansökan och intervjuer.

Så här ansöker du
Du ansöker via vårt rekryteringssystem senast 2022-02-13. Ansökan ska bestå av följande handlingar skrivna på svenska:

1. Kortfattad beskrivning (max 2 sidor) av varför du är intresserad av och lämpad för anställningen
2. Curriculum vitae (CV)
3. Kopia på examensbevis
4. En lista på dina universitetskurser, med betyg
5. Kopior på eventuella publikationer/examensarbete

Kontakt
Vid frågor rörande anställningen var vänlig kontakta universitetslektor Per Stenberg: Per.Stenberg@umu.se

Institutionen för ekologi, miljö och geovetenskap (EMG) bedriver forskning och forskarutbildning inom ämnena ekologi, miljövetenskap och naturgeografi. Institutionen har ca 150 medarbetare. För mer information, se www.emg.umu.se.