Stressresponsmodellering i IceLab: Doktorand i beräkningsfysik med fokus på organellers samordningsmekanismer under stress

Institutionen för fysik söker en doktorand i beräkningsfysik med fokus på att förstå samordningsmekanismerna mellan cellkärnan, mitokondrierna och kloroplasterna i växtceller. Anställning snarast enligt överenskommelse. Sista ansökningsdag är den 15 augusti.

Forskarskolan för stressresponsmodellering i IceLab
Från och med våren 2025 kommer Umeå universitets tvärvetenskapliga forskningsnav IceLab att erbjuda doktorandanställningar genom den nya forskarskolan för stressresponsmodellering. Forskarskolan finansieras av Knut och Alice Wallenbergs Stiftelse och Vetenskapsrådets excellenscenter. Den fokuserar på att modellera stressresponsmekanismer i levande system. För doktorander erbjuds ett omfattande kursprogram inom komplexitetsvetenskap.

Doktorandanställningen erbjuder en unik möjlighet att ingå i en grupp med andra doktorander inom forskarskolan och att utvecklas tillsammans genom anpassade kurser i enlighet med excellenscentrats tvärvetenskapliga tema.

Programmet förbereder nästa generations forskare inom beräkningsbiologi. Du får en stark grund i att förstå komplexa system och verktyg för att studera levande system på olika nivåer. Målet är att lösa stora utmaningar inom miljö- och livsvetenskaperna.

Kursutbudet omfattar ämnen som komplexitetsvetenskap, matematisk modellering inom evolution, ekologi och växtbiologi. Det inkluderar även överförbara färdigheter som kommunikation och samarbete mellan olika discipliner. Du får också möjlighet att delta i forskningsutbyten och bli en del av den stödjande och inspirerande miljön vid IceLab.

Bli en del av IceLab och arbeta i framkanten av tvärvetenskaplig forskning. Här kombineras matematisk modellering och dataanalys med olika ämnen som ekologi, växtfysiologi och molekylärbiologi. Din forskning kommer att fördjupa vår förståelse för hur levande system reagerar på stress och miljöförändringar, samtidigt som du utvecklas och växer i din forskarkarriär.

Läs mer om IceLab och Institutionen för fysik

Projektbeskrivning 
Projektet syftar till att avslöja de signalvägar som växter har utvecklat för att samordna aktiviteter mellan cellkärnan, mitokondrierna och kloroplasterna. Det kommer att innefatta utveckling av matematiska modeller, validering av dessa med experimentella data samt att göra förutsägelser. Det övergripande målet är att avkoda mekanismerna bakom samordningen mellan organeller. Förutom i växtceller är sådan samordning ett generellt problem för allt liv som genomgått endosymbios någon gång under sin evolutionära historia.

Beroende på den sökandes intressen kan projektet ta flera olika inriktningar. Ett alternativ är att använda systembiologiska metoder för att formulera ett system av ordinära differentialekvationer som beskriver hur gener reglerar varandra över olika organeller. En annan metod är att använda Monte Carlo-simuleringar för att undersöka vilka arkitekturer för genregleringsnätverk som krävs för robust reglering och effektiv kommunikation mellan cellens olika delar. En tredje möjlighet är att simulera de evolutionära fördelarna och de associerade kostnaderna för en cell som slukar en eller två separata organismer (endosymbios). Även om detta ger värdcellen nya förmågor, medför det också en ökad börda i form av komplex genreglering.

Anställningsvillkor
Anställningen syftar till en doktorsexamen och doktorandens huvuduppgift är att ägna sig åt egen forskarutbildning vilket innefattar vilket innefattar såväl aktivt deltagande i forskningsprojekt som forskarutbildningskurser. I arbetsuppgifterna kan undervisning och annat institutionsarbete (upp till 20%) ingå. Anställningen är tidsbegränsad till fyra år heltid eller upp till fem år vid undervisning deltid. Löneplaceringen sker enligt fastställd lönestege för doktorandanställning vid Umeå universitet.

Kompetenskrav
För att bli antagen till utbildning på forskarnivå krävs att den sökande har grundläggande behörighet genom avlagd examen på avancerad nivå, eller slutfört kurser om minst 240 högskolepoäng varav minst 60 högskolepoäng på avancerad nivå, eller motsvarande utländsk utbildning, eller motsvarande kvalifikationer.

För att uppfylla kravet på särskild behörighet att antas till utbildning på forskarnivå i beräkningsfysik krävs att den sökande har minst 90 högskolepoäng inom ämnesområdena fysik, datavetenskap, matematik, matematisk statistik eller närliggande områden, varav minst 30 högskolepoäng på avancerad nivå. Även kurser inom statistisk analys, kvantitativa metoder eller matematiska modeller som förvärvats utanför dessa ämnesområden kan räknas in.

Behörig är även den som på annat sätt inom eller utom landet förvärvat i huvudsak motsvarande kunskaper. Kraven på förkunskaper enligt ovan anses uppfyllda även av den som i annan ordning förvärvat i huvudsak motsvarande kunskaper.

Den framgångsrika kandidaten ska ha en masterexamen (eller motsvarande) i matematik, datavetenskap, fysik eller ett närliggande område. Utmärkta programmeringskunskaper i moderna programmeringsspråk är ett krav, liksom erfarenhet av beräknings- eller matematisk modellering. Erfarenhet av analys av biologiska data är meriterande. Kandidaten ska ha ett starkt intresse för tvärvetenskaplig forskning, vara mycket motiverad och ha förmåga att arbeta både självständigt och tillsammans med en forskargrupp. Mycket goda färdigheter i både talad och skriven engelska är ett krav.

Ansökan
Ansökan ska innehålla följande:

1. Ett personligt brev med en kort beskrivning av dina kvalifikationer, forskningsintressen och varför du är intresserad av anställningen (max 1 sida).
2. En meritförteckning/CV.
3. Styrkta kopior av relevanta examensbevis.
4. En lista på universitetskurser med betyg. För internationella sökande ska betygssystemet förklaras kortfattat.
5. Kopior av relevanta arbeten, såsom masteruppsats eller artiklar du har skrivit eller medförfattat. Om masteruppsatsen inte är klar vid sista ansökningsdag, ska en sammanfattning av projektet och aktuell status bifogas (max 5 sidor inklusive figurer och referenser).
6. Ditt GMAT- (eller GRE-) och TOEFL/IELTS-testresultat, om tillgängligt.
7. Kontaktuppgifter till två till tre referenspersoner.

Ansökan skickas in via e-rekryteringssystemet Varbi senast 2025-08-15. Alla dokument ska laddas upp i pdf-format.

Information
För mer information, kontakta Ludvig Lizana ludvig.lizana@umu.se, Åsa Strand asa.strand@umu.se, or Eric Libby, eric.libby@umu.se,

Välkommen med din ansökan!