Stressresponsmodellering i IceLab: Doktorand i beräkningsvetenskap med fokus på organellers samordningsmekanismer under stress

Institutionen för fysik söker en doktorand i beräkningsvetenskap med fokus på att förstå samordningsmekanismerna mellan cellkärnan, mitokondrierna och kloroplasterna i växtceller. Anställningen börjar i augusti 2025 eller enligt överenskommelse. Sista ansökningsdag är den 16 februari.

Forskarskolan för stressresponsmodellering i IceLab
Från och med våren 2025 kommer Umeå universitets tvärvetenskapliga forskningsnav IceLab att erbjuda doktorandanställningar genom den nya forskarskolan för stressresponsmodellering. Forskarskolan finansieras av Knut och Alice Wallenbergs Stiftelse och Vetenskapsrådets excellenscenter. Den fokuserar på att modellera stressresponsmekanismer i levande system. För doktorander erbjuds ett omfattande kursprogram inom komplexitetsvetenskap.

Doktorandanställningen erbjuder en unik möjlighet att ingå i en grupp med andra doktorander inom forskarskolan och att utvecklas tillsammans genom anpassade kurser i enlighet med excellenscentrats tvärvetenskapliga tema.

Programmet förbereder nästa generations forskare inom beräkningsbiologi. Du får en stark grund i att förstå komplexa system och verktyg för att studera levande system på olika nivåer. Målet är att lösa stora utmaningar inom miljö- och livsvetenskaperna.

Kursutbudet omfattar ämnen som komplexitetsvetenskap, matematisk modellering inom evolution, ekologi och växtbiologi. Det inkluderar även överförbara färdigheter som kommunikation och samarbete mellan olika discipliner. Du får också möjlighet att delta i forskningsutbyten och bli en del av den stödjande och inspirerande miljön vid IceLab.

Bli en del av IceLab och arbeta i framkanten av tvärvetenskaplig forskning. Här kombineras matematisk modellering och dataanalys med olika ämnen som ekologi, växtfysiologi och molekylärbiologi. Din forskning kommer att fördjupa vår förståelse för hur levande system reagerar på stress och miljöförändringar, samtidigt som du utvecklas och växer i din forskarkarriär.

Läs mer om IceLab och Institutionen för fysik

Projektbeskrivning 
Växtceller har två typer av organeller som ansvarar för fotosyntes och respiration: kloroplaster och mitokondrier. Det är kritiskt för växtceller att upprätthålla balansen mellan deras aktiviteter, särskilt under stressförhållanden.

Kloroplaster och mitokondrier utvecklades från fritt levande bakterier och blev "uppätna" av större celler genom endosymbois vid två oberoende händelser. Med tiden har dessa organeller genomgått omfattande reduktion av deras DNA, där de flesta av generna har överförts till DNA i cellkärnan. Detta har skapat en stark dynamisk koppling mellan organellerna och kärnan. Denna koppling kräver noggrann samordning mellan kärnan, mitokondrierna och kloroplasterna, som kan liknas vid ett cellulärt 'trekropparsproblem'.

Detta doktorandprojekt syftar till att avslöja de signalvägar som växter använder för att samordna aktiviteter mellan kärnan, mitokondrierna och kloroplasterna. Inom projektet kommer vi att utveckla och tillämpa matematiska modeller, och använda stokastiska simuleringar, metoder från komplexa nätverk, och experimentella data för att validera modellens förutsägelser och bestämma parametrar. Målet med projektet är att bättre förstå kritiska samordningsmekanismer.

Anställningsvillkor
Anställningen syftar till en doktorsexamen och doktorandens huvuduppgift är att ägna sig åt egen forskarutbildning vilket innefattar vilket innefattar såväl aktivt deltagande i forskningsprojekt som forskarutbildningskurser. I arbetsuppgifterna kan undervisning och annat institutionsarbete (upp till 20%) ingå. Anställningen är tidsbegränsad till fyra år heltid eller upp till fem år vid undervisning deltid. Löneplaceringen sker enligt fastställd lönestege för doktorandanställning vid Umeå universitet.

Kompetenskrav
För att bli antagen till utbildning på forskarnivå krävs att den sökande har grundläggande behörighet genom avlagd examen på avancerad nivå, eller slutfört kurser om minst 240 högskolepoäng varav minst 60 högskolepoäng på avancerad nivå, eller motsvarande utländsk utbildning, eller motsvarande kvalifikationer.

För att uppfylla kravet på särskild behörighet att antas till forskarutbildning i beräkningsvetenskap krävs att den sökande har minst 90 högskolepoäng inom beräkningsvetenskapliga ämnen (såsom tillämpad matematik, datavetenskap, fysik eller liknande områden) varav minst 30 högskolepoäng på avancerad nivå. Kraven behöver inte vara uppfyllda vid ansökningstillfället utan endast vid antagning.

Den framgångsrika kandidaten ska ha en masterexamen (eller motsvarande) i matematik, datavetenskap, fysik eller ett närliggande område. Utmärkta programmeringskunskaper i moderna programmeringsspråk är ett krav, liksom erfarenhet av beräknings- eller matematisk modellering. Erfarenhet av analys av biologiska data är meriterande. Kandidaten ska ha ett starkt intresse för tvärvetenskaplig forskning, vara mycket motiverad och ha förmåga att arbeta både självständigt och tillsammans med en forskargrupp. Mycket goda färdigheter i både talad och skriven engelska är ett krav.

Ansökan
Ansökan ska innehålla följande:

1. Ett personligt brev med en kort beskrivning av dina kvalifikationer, forskningsintressen och varför du är intresserad av anställningen (max 1 sida).
2. En meritförteckning/CV.
3. Styrkta kopior av relevanta examensbevis.
4. En lista på universitetskurser med betyg. För internationella sökande ska betygssystemet förklaras kortfattat.
5. Kopior av relevanta arbeten, såsom masteruppsats eller artiklar du har skrivit eller medförfattat. Om masteruppsatsen inte är klar vid sista ansökningsdag, ska en sammanfattning av projektet och aktuell status bifogas (max 5 sidor inklusive figurer och referenser).
6. Ditt GMAT- (eller GRE-) och TOEFL/IELTS-testresultat, om tillgängligt.
7. Kontaktuppgifter till tre referenspersoner.

Ansökan skickas in via e-rekryteringssystemet Varbi senast 2025-02-16. Alla dokument ska laddas upp i pdf-format.

Information
För mer information, kontakta Ludvig Lizana ludvig.lizana@umu.se, Åsa Strand asa.strand@umu.se, or Eric Libby, eric.libby@umu.se,

Välkommen med din ansökan!