Första forskningsingenjör inom ”single-cell transcriptomics” i asp - Befattningen är under tillsättning eller redan tillsatt, och det är inte längre möjligt att lämna in en ansökan

Institutionen för fysiologiskt botanik är en del av Umeå Plant Science Centre (UPSC; https://www.upsc.se) som är ett kompetenscentrum för experimentell växtforskning och skogsbioteknik i norra Sverige. Vi vill göra excellent och innovativ grundforskning och skapa kunskap till nytta för skogsbruk, jordbruk, miljö och samhälle. Vi studerar växter från cellnivå upp till ekofysiologi, samt från grundforskning till industriella tillämpningar. Vi försöker att förstå växters förmåga att växa, anpassa sig och acklimatisera sig till en föränderlig värld, kunskaper som kan leda till bättre växtsorter, odlingspraxis eller industriprocesser. 

Projektbeskrivning

De vedartade vävnaderna i skogsträd bildas i det vaskulära kambie-meristemet där celldelning bildar floemvävnad utåt och xylemvävnad inåt i stammen. Vi har tidigare gjort högupplösta transkriptomanalyser av vedartade vävnader i både asp och gran och identifierat vävnadsspecifika konserverade genuttrycksmönster och uttrycksnätverk mellan de två arterna. Nu vill vi öka upplösningen av transkriptomanalyserna genom att utföra RNA sekvensanalys i enskilda protoplaster. 

Arbetsuppgifter

Arbetet innebär att du ska odla aspträd i kontrollerade förhållanden i växthus och sedan isolera protoplaster från kambieregionen av träden. Därefter används chromiuminstrument för isolering och separation av enstaka protoplaster, preparation av cDNA och sekvensering. Därutöver ingår bioinformatisk analys av sekvenseringsresultat och validering av utvalda gener genom reportergenstudier.

Kvalifikationer

Sökande ska ha en doktorsexamen inom växtbiologi eller motsvarande. Erfarenhet av vedbiologi i skogsträd, ”single cell transcriptomics”, bioinformatik, FACS samt dokumenterad forskningserfarenhet inom växters cell- och molekylärbiologi krävs. Mycket god kunskap i muntlig och skriftlig engelska är ett krav, samt mycket god förmåga att arbeta självständigt, organisera arbetet samt god samarbetsförmåga. Du är motiverad och har ett stort intresse för ”single-cell transcriptomics”-analys. Erfarenhet av växtprotoplaster och cellodlingstekniker är meriterande.

Villkor 

Anställningen avser heltid och är tidsbegränsad till 1 år. Tillträde 1 juli 2022 eller enligt överenskommelse.

Ansökan

Ansökan skall innehålla (1) ett personligt brev (2) CV och (3) kopior på relevanta examen. Du ansöker via vårt e-rekryteringssystem. Ansök via knappen längst ner på sidan. Sista ansökningsdag är 10 juni 2022.

Kontakt

För mer information kontakta ett av värdlaboratorierna:

Nathaniel Street (nathaniel.street@umu.se) Institutionen för fysiologisk botanik, Umeå Universitet, Umeå

Hannele Tuominen (Hannele.tuominen@slu.se), Institutionen för skoglig genetik och växtfysiologi, Sveriges lantbruksuniversitet, Umeå

Välkommen med din ansökan!