Umeå universitet, Teknisk-naturvetenskaplig fakultet

Umeå universitet satsar på kreativa miljöer för studier och arbete. Hos oss finns attraktiva utbildningar, världsledande forskning och utmärkta innovations- och samverkansmöjligheter. Fler än 4 100 medarbetare och 34 000 studenter har redan valt Umeå universitet. Välj oss du också.

Umeå Plant Science Centre (UPSC) är ett internationellt erkänt centrum inom experimentell växtbiologi. Inom UPSC är forskning om växters cell- och molekylärbiologi, speciellt på skogsträd, ett profilområde. Institutionen för fysiologisk botanik, som är en del av UPSC, söker nu en förste forskningsingenjör med inriktning mot växtutveckling och genetik. Anställningen är på heltid, och tidsbegränsad till ett år (http://streetlab.upsc.se). Startdatum är den 1 september eller enligt överenskommelse.

Arbetsuppgifter:

Du kommer att arbeta med bioinformatik i en gemensam forskningsmiljö på institutionen för fysiologisk botanik med samarbete med forskningsgrupper på SciLifeLab (Science for Life Laboratory), NBIS (National BioInformatics Service) och Norway Spruce and Scots pine genome project team.

Arbetet innefattar utveckling och implementering av pseudogen identifikation, uttryckskvantifiering och analyspipeline. Du kommer även från Genome project, kunna komma att kallas in som expert. All källkod i projektet kommer att göras offentlig och måste följa principer kring transparent och reproducerbar forskning.

Kvalifikationer:

Du har en doktorsexamen inom växters cell- och molekylärbiologi eller motsvarande. Du ska ha omfattande erfarenhet av genomassembly annotering av gener och repetiva regioner, de novo transkriptsassembly sam genuttrycks-och co-uttrycksanalys av RNA-sekvenseringsdata. Du ska ha erfarenhet av så kallad full stack-utveckling och/eller erfarenhet av att skriva komplexa skript (i tex Python), dokumenterad erfarenhet, och expertis av att utveckla arbetsflöden för reproducerbar analys som i sin tur delas offentligt för delning av kod. Du är skicklig i programmeringsspråken C eller C++ och har erfarenhet av att implementera parallelliserad programvara med tex OpenMP och Open MPI för att passa till den här tjänsten. Vidare krävs det utmärkta färdigheter inom R-programmering och dataanalys. Erfarenhet av att arbeta med heterozygota och fragmenterade genomassemblies är mycket meriterande. Dokumenterad erfarenhet av hantering av RNA-sekvenseringsdata, inklusive arbete i HPC-miljö (High Performance Computing; högpresterande datorsystem) med bland annat kunskap om olika kylsystem är ett krav. Utmärkt förmåga att kommunicera både i tal och skrift, mycket bra engelska kunskaper, en vilja att lära sig nya färdigheter och att samarbeta i grupp är av största vikt.

Ansökan: 

Ansökan ska innehålla:

  • Ett personligt brev där du beskriver dig själv, och dina tidigare relevanta forskningserfarenheter. Brevet ska innehålla länkar till dina tidigare arbeten inom webbutveckling, användargränssnitt och webbdesign som kan visa varför du är kvalificerad till tjänsten.
  • CV
  • En publikationslista inklusive en länk till din doktorsavhandling. Styrkta kopior av betyg och examensbevis.
  • Kontaktuppgifter till två referenspersoner.
  • Övriga handlingar du vill åberopa.

Ansökan görs genom vårt elektroniska rekryteringssystem. Handlingar som skickas elektroniskt ska vara i formaten Word eller PDF. Logga in på systemet och ansök via knappen i slutet av denna sida. Sista ansökningsdag är 3 augusti 2020.

Vi ser fram emot att få din ansökan!

 

 

Anställningsform Visstidsanställning längre än 6 månader
Anställningens omfattning Heltid
Tillträde 1 september eller enligt överenskommelse
Löneform månadslön
Antal lediga befattningar 1
Sysselsättningsgrad 100
Ort Umeå
Län Västerbottens län
Land Sverige
Referensnummer AN 2.2.1-899-20
Kontakt
  • Nathaniel Street, 072-537 2003
Facklig företrädare
  • SACO, 090-786 53 65
  • SEKO, 090-786 52 96
  • ST, 090-786 54 31
Publicerat 2020-07-13
Sista ansökningsdag 2020-08-03

Tillbaka till lediga jobb