Umeå universitet, Medicinska fakulteten

Umeå universitet är ett av Sveriges största lärosäten med över 37 000 studenter och cirka 4 700 anställda. Vid universitetet finns en mångfald av utbildningar av hög kvalitet och världsledande forskning inom flera vetenskapsområden, och här gjordes den banbrytande upptäckten av gensaxen CRISPR-Cas9 som tilldelats Nobelpriset i kemi. Vid Umeå universitet är allt nära. Våra sammanhållna campus gör det lätt att mötas, samarbeta och utbyta kunskap, något som gynnar en dynamisk och öppen kultur.

Den samhällsomvandling och de stora gröna investeringar vi ser i norra Sverige skapar enorma möjligheter och komplexa utmaningar. För Umeå universitet handlar det om att bedriva forskning om – och mitt i – ett samhälle i omvandling. Men också om att leverera utbildningar för regioner som behöver expandera fort och hållbart. Det är helt enkelt här framtiden skapas.

Är du intresserad av att veta mer? Läs mer om Umeå universitet som arbetsplats.

Medicinska fakulteten är en av de största fakulteterna vid Umeå universitet och attraherar många studenter med ett omfattande utbud av utbildningar inom områdena medicin, tandvård, hälsa och vård. Vi erbjuder en väl utvecklad forskningsinfrastruktur och en inspirerande, dynamisk miljö med ledande forskning. Vår nära samverkan med de fyra regionerna i Norra sjukvårdsregionen ser vi som en stor ömsesidig tillgång för att utveckla forskning och utbildning och att säkra tillgången på vår framtids vårdpersonal.

Institutionen för Molekylärbiologi söker en projektassistent, 6 månader, till projektet “ Multimodal data generering och integration för att studera bakteriell patogenes” Handledare: Kemal Avican.

Bakgrund och beskrivning av arbetsuppgifter

Bakteriell patogenes är en komplex process som kräver en djup förståelse för interaktionen mellan bakterier och deras värd. Uppkomsten av antibiotikaresistens har gjort studier av dessa interaktioner ännu mer kritiskt. Detta projekt, ‘Multimodal data generering och integration för att studera bakteriell patogenes’, syftar till att utöka vår förståelse av dessa interaktioner genom att generera och integrera multimodala data inklusive transkriptom, proteom och tillväxt under stress förhållanden. Projektet kommer att identifiera nyckeldeterminanter i bakterier som är väsentliga för patogenes och som potentiellt kan riktas mot nya antimikrobiella medel. Genom att studera dessa determinanter, hoppas vi kunna avslöja mekanismer som är kritiska för bakterier att orsaka infektion hos människor. Detta projekt är en del av ett pågående forskningsprogram finansierat av Vetenskapsrådet. Programmet syftar till att bekämpa mänskliga bakterieinfektioner genom att undersöka bakteriellt transkriptom, proteom, tillväxtfenotyper, samt bakteriella patogener. Detta projekt kommer att dra nytta av PATHOgenex (www.pathogenex.org) dataset och använda biokomputationella analyser för att få insikt i bakteriell patogenes. Arbetsuppgifterna för projektassistenten inkluderar att designa och utföra experiment, integrera och analysera multimodala data och skriva rapporter under handledning av gruppledaren. Denna anställning erbjuder en unik möjlighet att bidra till ett viktigt forskningsområde och att utveckla färdigheter inom datagenerering och integration. 

Som projektassistent kommer du under handledning att:

 1) Identifiera olika uttrycksmönster för mRNA och protein under en mängd olika stress förhållanden.

 2) Skilja mellan olika kapacitet för kolonibildning hos diverse mänskliga bakteriella patogener med automatiskt koloniscreeningssystem under stress förhållanden.

Som projektassistent kommer du att arbeta med olika vetenskapliga metoder relaterade till mikrobiologi, biokemi och molekylärbiologi. Detta inkluderar att förbereda bibliotek för nästa generations sekvensering (NGS) och proteomik. Kandidaten kommer också att hantera data för transkriptomik, proteomik och bilddata från dessa experiment samt utföra bioinformatik och dokumentera och presentera resultaten.

Kvalifikationer 

Du ska ha en universitetsexamen motsvarande en europeisk kandidatexamen i biovetenskap eller datateknik (eller motsvarande forskningsområde) vid tidpunkten för rekryteringen. Starkt meriterande är en masterexamen (240hp) inom något av ovanstående områden. Vidare krävs dokumenterad erfarenhet av tekniker inom mikrobiologi och molekylärbiologi, bioinformatik riktad mot NGS och proteomik, samt bilddata. Programmerings erfarenhet i R och Matlab är ett krav samt erfarenhet av att använda maskininlärningsalgoritmer på NGS-data är önskvärt.  Kandidaten ska vara  entusiastisk och intresserad av infektions biologi och bioinformatik, samt  kunna kommunicera och skriva flytande engelska.

Vi söker en mycket motiverad person som har förmågan att arbeta produktivt i ett team, samt excellent  kommunikationsförmåga med kollegor, seniora forskare och granskare.

Ansökan

Du ansöker genom vårt rekryteringssystem. Din ansökan ska innehålla följande dokument skrivna på engelska eller svenska:

• CV med information om utbildning, förteckning över tidigare och nuvarande anställningar, och en lista över vetenskapliga publikationer.

• Ett följebrev som beskriver forskningserfarenhet och forskningsintressen samt motivering till varför du söker tjänsten.

• Kontaktuppgifter för en till tre referenspersoner.

För frågor om tjänsten kontakta Kemal Avican, e-post: kemal.avican@umu.se

Mer om oss

Kemal Avicans lab är del av Umeå Centre for Microbial Research UCMR, www.ucmr.umu.se, en interdisciplinär forskningsmiljö med mer än 50 forskargrupper som utför grundforskning av i högsta klass och driver utveckling av nya teknologier i mikrobiologi och infektions biologi och Icelab (www.icelab.se), en interdisciplinär hub som aktivt främjar olika evenemang och aktiviteter där forskare från olika discipliner möts för att identifiera och diskutera samband. 

Mer information om oss finner du på: www.ucmr.umu.se, www.icelab.se and Department of Molecular Biology (umu.se)

Välkommen med din ansökan!

Anställningsform Särskild visstidsanställning
Anställningens omfattning Heltid
Tillträde 2024-07-01, eller enligt överenskommelse.
Löneform Månadslön
Antal lediga befattningar 1
Sysselsättningsgrad 100
Ort Umeå
Län Västerbottens län
Land Sverige
Referensnummer AN 2.2.1-873-24
Kontakt
  • Kemal Avican, kemal.avican@umu.se
Facklig företrädare
  • SACO, 090-7865365
  • SEKO, 090-7865296
  • ST, 090-7865431
Publicerat 2024-05-23
Sista ansökningsdag 2024-06-13
Sök jobbet

Dela länkar

Tillbaka till lediga jobb