Staff scientist inom metagenomik 

Umeå Plant Science Center (UPSC) är en av Europas starkaste forskningsmiljöer för växtgrundforskning (www.upsc.se). Vårt gemensamma mål är att förstå växternas anpassningsförmåga och acklimatisering till en föränderlig omvärld.

Institutionen för fysiologisk botanik (www.umu.se/en/department-of-plant-physiology/), som är en av parterna i UPSC, söker en Staff scientist som ska arbeta med metagenomikdata. Anställningen avser heltid och är tidsbegränsad till 12 månader. Tillträde omgående eller enligt överenskommelse.

Projektbeskrivning och arbetsuppgifter

Arbetet innebär att analysera DNA-amplicondata från tidsserier som samlats in från rötter av norsk gran och tall. Den anställdes uppgift blir att bearbeta dessa datamängder för att identifiera övergripande mönster i de svamp- och bakteriesamhällen som finns i jorden och som påverkas av säsongsförändringar, experimentella behandlingar och skogstyp. Mer specifikt kommer du att identifiera bakterier som kan spela en stödjande roll i träds ektomykorrhiza-associationer och utveckla metoder för att odla dessa bakterier, så att de kan användas i riktade experimentella tester.

Kvalifikationer

Vi söker dig som är engagerad och teamorienterad med dokumenterad erfarenhet inom växt- och/eller svamp- och bakteriebioinformatik. För att vara kvalificerad ska den sökande ha en doktorsexamen eller motsvarande inom ett ämnesområde som är relevant för tjänsten, exempelvis mykologi, mikrobiologi med fokus på växt-mikrobinteraktioner, växtens molekylärgenetik eller växtbiokemi.

Dokumenterade färdigheter inom bioinformatik är ett krav för anställningen, och du ska också ha erfarenhet av att analysera amplicon-sekvenseringsdata, genomföra analyser på högpresterande datorinfrastruktur samt kunna påvisa att du framgångsrikt drivt sådana projekt fram till publicering.

Utöver detta ska du ha erfarenhet av att identifiera intressanta bakterier från komplexa jordbakteriesamhällen och att utveckla metoder för att isolera och odla dessa bakterier för vidare analyser. Goda kunskaper i minst ett relevant programmerings- eller skriptspråk, exempelvis R, Java eller Python är nödvändiga. Utmärkta engelska kunskaper, både muntligt och skriftligt, är också ett krav.

Det är meriterande om du har dokumenterad kunskap och erfarenhet av att analysera växtinteraktioner med biotiska partners. 

Ansökan

Ansökan ska innehålla:

• Ett personligt brev där du beskriver dig själv, och dina tidigare relevanta forskningserfarenheter. Brevet ska innehålla länkar till dina tidigare arbeten inom webbutveckling, användargränssnitt och webbdesign som kan visa varför du är kvalificerad för anställningen max 2 sidor).
• CV
• Styrkt kopia av doktorsexamensbevis
• En publikationslista inklusive en länk till din doktorsavhandling.
• Styrkta kopior av betyg och examensbevis.
• Övriga handlingar du vill åberopa.

Du ansöker via vårt e-rekryteringssystem. Ansök via knappen längst ner på sidan. Sista ansökningsdag är den 27 december 2024. 

För mer information, vänligen kontakta professor Nathaniel Street, +46-(0)90-786 5473, nathaniel.street@umu.se. 

Välkommen med din ansökan!