Staff Scientist i bioinformatik

Umeå universitet, Medicinska fakulteten

Umeå universitet är ett av Sveriges största lärosäten med över 37 000 studenter och cirka 4 700 anställda. Vid universitetet finns en mångfald av utbildningar av hög kvalitet och världsledande forskning inom flera vetenskapsområden, och här gjordes den banbrytande upptäckten av gensaxen CRISPR-Cas9 som tilldelats Nobelpriset i kemi. Vid Umeå universitet är allt nära. Våra sammanhållna campus gör det lätt att mötas, samarbeta och utbyta kunskap, något som gynnar en dynamisk och öppen kultur.

Den samhällsomvandling och de stora gröna investeringar vi ser i norra Sverige skapar enorma möjligheter och komplexa utmaningar. För Umeå universitet handlar det om att bedriva forskning om – och mitt i – ett samhälle i omvandling. Men också om att leverera utbildningar för regioner som behöver expandera fort och hållbart. Det är helt enkelt här framtiden skapas.

Är du intresserad av att veta mer? Läs mer om Umeå universitet som arbetsplats.

Medicinska fakulteten är en av de största fakulteterna vid Umeå universitet och attraherar många studenter med ett omfattande utbud av utbildningar inom områdena medicin, tandvård, hälsa och vård. Vi erbjuder en väl utvecklad forskningsinfrastruktur och en inspirerande, dynamisk miljö med ledande forskning. Vår nära samverkan med de fyra regionerna i Norra sjukvårdsregionen ser vi som en stor ömsesidig tillgång för att utveckla forskning och utbildning och att säkra tillgången på vår framtids vårdpersonal.

Institutionen för molekylärbiologi vid Umeå universitet, inbjuder sökande till en tjänst som forskare inom bioinformatik. Tjänsten är tidsbegränsad till fyra månader och förväntas starta den 1 januari 2025 eller enligt överenskommelse. Sista ansökningsdag 5 december 2024.

Projektbeskrivning

Tarmmikrobiotan spelar en central roll i att upprätthålla en effektiv slemhinnebarriärfunktion. I det aktuella projektet kommer kandidaten att studera hur kostmönster påverkar tarmmikrobiomet och slembarriärfunktionen. Vi strävar efter att förstå hur kosten formar den mikrobiella sammansättningen och påverkar den funktionella integriteten hos slembarriären. Vår metod integrerar helgenomsekvensering, RNA-sekvensering och metabolomik. Tillsammans tillåter dessa metoder oss att identifiera mikrobiella molekyler och vägar som spelar en kritisk roll i att upprätthålla tarmbarriärfunktionen.

Arbetsuppgifter

Analysera helgenomsekvenseringsdata för att profilera den taxonomiska och funktionella sammansättningen av mikrobiella samhällen och bedöma metaboliska vägar.
Utföra RNA-sekvensanalys för att studera värd-mikrob-interaktioner.
Integrera multi-omics data. Analysera 16S rDNA-sekvenseringsdata från mus- och människotarmmikrobiom. Ge bioinformatikstöd till teamet.

Kvalifikationer

Vi söker högt motiverade kandidater med en doktorsexamen i molekylärbiologi eller relaterad disciplin, med dokumenterad erfarenhet av studier av tarmmikrobiota och kostfiber med särskilt fokus på kolhydratnedbrytande enzymer. Du bör ha praktisk erfarenhet av sekvensanalyser av tarmmikrobiota (16S, metagenomik), RNA-sekvensanalys och multi-omics analyser. Du bör ha en stark relevant forskningsproduktion, vilket framgår av förstaförfattarskap eller publikationer som presenterar banbrytande nya forskningsresultat inom mikrobiotafältet.

Kandidaten måste vara flytande i tal och skrift på engelska. Projektet kommer att vara av samarbetskaraktär och då förväntas kandidaten kunna fungera i ett team med god samarbetsförmåga. Utmärkta kommunikationsfärdigheter krävs för att effektivt interagera med kollegor, samt samarbetspartners från kompletterande forskningsområden. God initiativförmåga och erfarenhet av att ansöka om forskningsfinansiering är ett krav.

Meriterande är om kandidaten har genomfört postdoktorala studier vid ett annat universitet än där doktorandstudierna genomfördes.

Ansökan

Din ansökan måste göras via vårt e-rekryteringssystem Varbi och måste vara mottagen senast den 5 december 2024. Ansökan måste innehålla följande dokument skrivna på engelska eller svenska:

· Ett personligt följebrev som förklarar varför du är intresserad av tjänsten, hur du kan bidra till projektet och i vilken riktning du vill utveckla det (högst 2 A4-sidor).

· En meritförteckning som dokumenterar akademisk utbildning och tidigare anställningar.

· En lista över dina publikationer.

· En kopia av doktorsexamen och andra relevanta examensbevis.

· Namn och kontaktuppgifter med e-postadresser till två eller tre akademiska referenser.

· Annan relevant dokumentation som du vill inkludera till stöd för din ansökan.

Mer om oss

Du kan hitta mer information om oss på https://www.umu.se/en/department-of-molecular-biology/. För frågor angående tjänsten, vänligen kontakta projektledaren: Björn Schröder bjorn.schroder@umu.se

Vi välkomnar din ansökan!

Umeå universitet vill erbjuda en jämställd och jämlik miljö där öppna samtal mellan människor med olika bakgrund och perspektiv lägger grunden för lärande, skaparkraft och utveckling. Vi välkomnar därför personer med olika bakgrunder och erfarenheter att söka den aktuella anställningen.

Till bemannings- och rekryteringsföretag och till dig som är försäljare: Vi undanber oss vänligen men bestämt direktkontakt med bemannings- och rekryteringsföretag samt försäljare av ytterligare jobbannonser.