Staff Scientist i bioinformatik

Institutionen för molekylärbiologi vid Umeå universitet, inbjuder sökande till en tjänst som forskare inom bioinformatik. Tjänsten är tidsbegränsad till fyra månader och förväntas starta den 1 januari 2025 eller enligt överenskommelse. Sista ansökningsdag 5 december 2024.

Projektbeskrivning

Tarmmikrobiotan spelar en central roll i att upprätthålla en effektiv slemhinnebarriärfunktion. I det aktuella projektet kommer kandidaten att studera hur kostmönster påverkar tarmmikrobiomet och slembarriärfunktionen. Vi strävar efter att förstå hur kosten formar den mikrobiella sammansättningen och påverkar den funktionella integriteten hos slembarriären. Vår metod integrerar helgenomsekvensering, RNA-sekvensering och metabolomik. Tillsammans tillåter dessa metoder oss att identifiera mikrobiella molekyler och vägar som spelar en kritisk roll i att upprätthålla tarmbarriärfunktionen.

Arbetsuppgifter

Analysera helgenomsekvenseringsdata för att profilera den taxonomiska och funktionella sammansättningen av mikrobiella samhällen och bedöma metaboliska vägar.
Utföra RNA-sekvensanalys för att studera värd-mikrob-interaktioner.
Integrera multi-omics data. Analysera 16S rDNA-sekvenseringsdata från mus- och människotarmmikrobiom. Ge bioinformatikstöd till teamet.

Kvalifikationer

Vi söker högt motiverade kandidater med en doktorsexamen i molekylärbiologi eller relaterad disciplin, med dokumenterad erfarenhet av studier av tarmmikrobiota och kostfiber med särskilt fokus på kolhydratnedbrytande enzymer. Du bör ha praktisk erfarenhet av sekvensanalyser av tarmmikrobiota (16S, metagenomik), RNA-sekvensanalys och multi-omics analyser. Du bör ha en stark relevant forskningsproduktion, vilket framgår av förstaförfattarskap eller publikationer som presenterar banbrytande nya forskningsresultat inom mikrobiotafältet.

Kandidaten måste vara flytande i tal och skrift på engelska. Projektet kommer att vara av samarbetskaraktär och då förväntas kandidaten kunna fungera i ett team med god samarbetsförmåga. Utmärkta kommunikationsfärdigheter krävs för att effektivt interagera med kollegor, samt samarbetspartners från kompletterande forskningsområden. God initiativförmåga och erfarenhet av att ansöka om forskningsfinansiering är ett krav.

Meriterande är om kandidaten har genomfört postdoktorala studier vid ett annat universitet än där doktorandstudierna genomfördes.

Ansökan

Din ansökan måste göras via vårt e-rekryteringssystem Varbi och måste vara mottagen senast den 5 december 2024. Ansökan måste innehålla följande dokument skrivna på engelska eller svenska:

·         Ett personligt följebrev som förklarar varför du är intresserad av tjänsten, hur du kan bidra till projektet och i vilken riktning du vill utveckla det (högst 2 A4-sidor).

·         En meritförteckning som dokumenterar akademisk utbildning och tidigare anställningar.

·         En lista över dina publikationer.

·         En kopia av doktorsexamen och andra relevanta examensbevis.

·         Namn och kontaktuppgifter med e-postadresser till två eller tre akademiska referenser.

·         Annan relevant dokumentation som du vill inkludera till stöd för din ansökan.

Mer om oss

Du kan hitta mer information om oss på https://www.umu.se/en/department-of-molecular-biology/. För frågor angående tjänsten, vänligen kontakta projektledaren: Björn Schröder bjorn.schroder@umu.se

Vi välkomnar din ansökan!