Första forskningsingenjör inom ”single-cell transcriptomics” i asp

Umeå universitet, Teknisk-naturvetenskaplig fakultet

Umeå universitet är ett av Sveriges största lärosäten med över 37 000 studenter och cirka 4 700 anställda. Vid universitetet finns en mångfald av utbildningar av hög kvalitet och världsledande forskning inom flera vetenskapsområden, och här gjordes den banbrytande upptäckten av gensaxen CRISPR-Cas9 som tilldelats Nobelpriset i kemi. Vid Umeå universitet är allt nära. Våra sammanhållna campus gör det lätt att mötas, samarbeta och utbyta kunskap, något som gynnar en dynamisk och öppen kultur.

Den samhällsomvandling och de stora gröna investeringar vi ser i norra Sverige skapar enorma möjligheter och komplexa utmaningar. För Umeå universitet handlar det om att bedriva forskning om – och mitt i – ett samhälle i omvandling. Men också om att leverera utbildningar för regioner som behöver expandera fort och hållbart. Det är helt enkelt här framtiden skapas.

Är du intresserad av att veta mer? Läs mer om Umeå universitet som arbetsplats.

Umeå Plant Science Centre (UPSC) är ett av Europas starkaste forskningscentrum inom experimentell växtbiologi. Här har du tillgång till de senaste instrumenten och ett en miljö med mer än 200 växtforskare. Vår forskning spänner från biokemi och molekylärbiologi till fysiologi och ekosystem forskning (www.upsc.se).

Institutionen för fysiologiskt botanik är en del av Umeå Plant Science Centre (UPSC; https://www.upsc.se) som är ett kompetenscentrum för experimentell växtforskning och skogsbioteknik i norra Sverige. Vi vill göra excellent och innovativ grundforskning och skapa kunskap till nytta för skogsbruk, jordbruk, miljö och samhälle. Vi studerar växter från cellnivå upp till ekofysiologi, samt från grundforskning till industriella tillämpningar. Vi försöker att förstå växters förmåga att växa, anpassa sig och acklimatisera sig till en föränderlig värld, kunskaper som kan leda till bättre växtsorter, odlingspraxis eller industriprocesser.

Projektbeskrivning

De vedartade vävnaderna i skogsträd bildas i det vaskulära kambie-meristemet där celldelning bildar floemvävnad utåt och xylemvävnad inåt i stammen. Vi har tidigare gjort högupplösta transkriptomanalyser av vedartade vävnader i både asp och gran och identifierat vävnadsspecifika konserverade genuttrycksmönster och uttrycksnätverk mellan de två arterna. Nu vill vi öka upplösningen av transkriptomanalyserna genom att utföra RNA sekvensanalys i enskilda protoplaster.

Arbetsuppgifter

Arbetet innebär att du ska odla aspträd i kontrollerade förhållanden i växthus och sedan isolera protoplaster från kambieregionen av träden. Därefter används chromiuminstrument för isolering och separation av enstaka protoplaster, preparation av cDNA och sekvensering. Därutöver ingår bioinformatisk analys av sekvenseringsresultat och validering av utvalda gener genom reportergenstudier.

Kvalifikationer

Sökande ska ha en doktorsexamen inom växtbiologi eller motsvarande. Erfarenhet av vedbiologi i skogsträd, ”single cell transcriptomics”, bioinformatik, FACS samt dokumenterad forskningserfarenhet inom växters cell- och molekylärbiologi krävs. Mycket god kunskap i muntlig och skriftlig engelska är ett krav, samt mycket god förmåga att arbeta självständigt, organisera arbetet samt god samarbetsförmåga. Du är motiverad och har ett stort intresse för ”single-cell transcriptomics”-analys. Erfarenhet av växtprotoplaster och cellodlingstekniker är meriterande.

Villkor

Anställningen avser heltid och är tidsbegränsad till 1 år. Tillträde 1 juli 2022 eller enligt överenskommelse.

Ansökan

Ansökan skall innehålla (1) ett personligt brev (2) CV och (3) kopior på relevanta examen. Du ansöker via vårt e-rekryteringssystem. Ansök via knappen längst ner på sidan. Sista ansökningsdag är 10 juni 2022.

Kontakt

För mer information kontakta ett av värdlaboratorierna:

Nathaniel Street (nathaniel.street@umu.se) Institutionen för fysiologisk botanik, Umeå Universitet, Umeå

Hannele Tuominen (Hannele.tuominen@slu.se), Institutionen för skoglig genetik och växtfysiologi, Sveriges lantbruksuniversitet, Umeå

Välkommen med din ansökan!

Umeå universitet vill erbjuda en jämställd och jämlik miljö där öppna samtal mellan människor med olika bakgrund och perspektiv lägger grunden för lärande, skaparkraft och utveckling. Vi välkomnar därför personer med olika bakgrunder och erfarenheter att söka den aktuella anställningen.

Till bemannings- och rekryteringsföretag och till dig som är försäljare: Vi undanber oss vänligen men bestämt direktkontakt med bemannings- och rekryteringsföretag samt försäljare av ytterligare jobbannonser.

Anställningsform	Tidsbegränsad anställning
Anställningens omfattning	Heltid
Tillträde	1 juli 2022 eller enligt överenskommelse
Löneform	Fast månadslön
Antal lediga befattningar	1
Sysselsättningsgrad	100
Ort	Umeå
Län	Västerbottens län
Land	Sverige
Referensnummer	AN 2.2.1-909-22
Kontakt	Nathaniel Street , 090-7865473
Facklig företrädare	SACO, 090-7865365 SEKO, 090-7865296 ST, 090-7865431
Publicerat	2022-05-20
Sista ansökningsdag	2022-06-10